Kvalifikacije za ligo prvakov se bodo sicer začele 27. septembra. Iz kvalifikacij se bo v skupinski del prebilo osem klubov. V rednem delu sezone - tekme bodo ob torkih in sredah - bo v štirih skupinah igralo 32 moštev (tudi Helios), tekmovanje v tem delu se bo začelo 18. oktobra in končalo februarja 2017. Najboljše štiri ekipe iz vsake skupine se bodo prebile v končnico, pete in šeste ekipe bodo igrale v končnici evropskega pokala, sedme in osme pa bodo končale tekmovanje.
Končnica lige prvakov se bo začela z osmino finala, sledile pa bodo četrtfinalne tekme. Najboljša štiri moštva bodo prvaka odločila na zaključnem turnirju, ki bo med 28. in 30. aprilom 2017.
Skupine lige prvakov
Skupina A: Helios Suns, Banvit, Fraport Skyliners, Aris, Nymburk, Monaco, Donar/Tartu - Bakken/Sassari, Rilski/Tsmoki Minsk - Ironi Nahariya;
Skupina B: Pinar Karsiyaka, Venezia, Avtodor, Maccabi RM, Himik, Le Mans, Kataja/Södertalje - Charleroi, Lukoil - Oradea/Prievidza;
Skupina C: Asvel, EWE Baskets, Paok, Neptunas, Rosa Radom, Ventspils, Usak - AEK/Cluj, Benfica/Varese - Szolnoki;
Skupina D: Strasbourg, Avellino, Tenerife, Oostende, Cibona, Mega Leks, Igokea/Mornar - Besiktas, Riesen - Porto/Juventus Utena.
